服务热线02152235399
单细胞免疫组库测序一次实验可以同时检测近万个细胞，可在一个样本中同时获5'端mRNA表达谱、TCR和BCR的信息，结合基因的表达谱和V（D）J数据进行复杂组织样本的影响免疫应答分析，监测免疫疗法的效果，研究疾病发生和发展的分子机制。
Lei Zhang et al. Nature,2018.
1. 1000+ TCR/BCR项目经验，一次实验可同时获取1000-10000个细胞的文库构建，获得转录组和免疫组数据。
2. 具备完善的免疫组库测序和实验质控流程，获取V（D）J全长序列的配对信息
3. 丰富的免疫组库测序和数据分析经验，实现专属个性化数据分析服务，搭配单细胞分析云平台，一键导出交互性的动态结果报告。
样本类型：
组织、血液、培养的细胞系、制备好的单细胞悬液
注：若客户样本为组织，且无能力进行组织解离来获取单细胞悬液，烈冰将尽可能提供技术及实验上的帮助，但因不同类型样本的特异性，无法保证实验方法适用于所有类型组织。
质量要求：
1. 细胞活性大于70%；
2. 浓度为500-2000细胞/μl；
3. 体积不小于200μl；
4. 细胞培养基及缓冲液不能含Ca2+和Mg2+；
5. 细胞体积小于40μm。
V（D）J基因的使用频率：上图主要展示了TCR序列中V基因的使用情况
注：横坐标为V基因，纵坐标为J基因
V-J基因组合频率：下图主要展示了TCR序列中V-J基因组合情况。
注：横坐标为CDR3长度分布，纵坐标为细胞占比
CDR3序列长度：上图主要展示了CDR3序列的长度分布，以及使用频率最高的12个TRAV基因对应的CDR3长度信息。
注：横坐标为clonotype编号，纵坐标为细胞占比
克隆频率统计：该图主要展示了TOP50 clonotype对应的细胞占比。
注：Unique或数字： 每个clonotype对应的细胞数（size）
克隆增殖统计：下图主要展示了不同size对应的clonotype的占比情况
注：右图中，XY轴均为cluster编号，括号内为该cluster中检测到TCR序列的细胞数
注：横向纵向均为样本名称，括号内为该样本中检测到的clonotype数，色块内为overlap的clonotype数。
[1] Rat, J. A., et al.(2020). Single-cell transcriptomics identifies multiple pathways underlying antitumor function of TCR- And CD8αβ-engineered human CD4+ T cells. Science Advances, 6(27), 1–16. https://doi.org/10.1126/sciadv.aaz7809
[2] Ohigashi, I., et al.(2021). The thymoproteasome hardwires the TCR repertoire of CD8+ T cells in the cortex independent of negative selection. Journal of Experimental Medicine, 218(4). https://doi.org/10.1084/JEM.20201904
[3] He, S., Wang, et al.(2020). Single-cell transcriptome profiling an adult human cell atlas of 15 major organs. BioRxiv, 1–34. https://doi.org/10.1101/2020.03.18.996975
[4] Pauken, K. E., et al.(2021). Single-cell analyses identify circulating anti-tumor CD8 T cells and markers for their enrichment. Journal of Experimental Medicine, 218(4). https://doi.org/10.1084/JEM.20200920
[5] Reitermaier, R., et al.(2021). αβγδ T cells play a vital role in fetal human skin development and immunity. Journal of Experimental Medicine, 218(4). https://doi.org/10.1084/JEM.20201189
[6] Renand, A.,et al.(2020). Integrative molecular profiling of autoreactive CD4 T cells in autoimmune hepatitis. Journal of Hepatology, 73(6), 1379–1390. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2020.05.053